TEXT   117

Sample_Info_RAW_ChIP-chip.txt

Guest on 8th August 2021 06:27:17 PM

  1. File Name                               |       Sample Name|    Genotype           |    Treatment|      Material Type             |     Ecotype|        Antibody |
  2. chip_18_(Atdschip_tiling)_2.CEL         |       IP_H1.1_C1 |    promH1.1::H1.1::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  3. chip_19_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.1_C2 |    promH1.1::H1.1::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  4. chip_20_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.1_C3 |    promH1.1::H1.1::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  5. chip_25_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.2_C1 |    promH1.2::H1.2::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  6. chip_26_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.2_C2 |    promH1.2::H1.2::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  7. chip_28_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.2_C3 |    promH1.2::H1.2::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  8. chip_H1_3n1_(Atdschip_expr)_2.CEL       |       IP_H1.3_C1 |    promH1.3::H1.3::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  9. chip_H1_3n2_(Atdschip_expr)_2.CEL       |       IP_H1.3_C2 |    promH1.3::H1.3::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  10. chip_H3_22_(Atdschip_expr)_2.CEL        |       IP_H3_C1   |    promH1.3::H1.3::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  11. chip_H3_23_(Atdschip_tiling)_2.CEL      |       IP_H3_C2   |    promH1.3::H1.3::GFP|    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  12. chip_H3_36_(Atdschip_expr)_2.CEL        |       IP_H3_C3   |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  13. chip_01_(Atdschip_tiling)_2.CEL         |       IP_H1.1_S1 |    promH1.1::H1.1::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  14. chip_2_(Atdschip_tiling)_2.CEL          |       IP_H1.1_S2 |    promH1.1::H1.1::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  15. chip_4plus5_(Atdschip_expr)_2.CEL       |       IP_H1.1_S3 |    promH1.1::H1.1::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  16. chip_10_(Atdschip_tiling)_2.CEL         |       IP_H1.2_S1 |    promH1.2::H1.2::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  17. chip_11_(Atdschip_expr)_2.CEL           |       IP_H1.2_S2 |    promH1.2::H1.2::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  18. chip_12_(Atdschip_tiling)_2.CEL         |       IP_H1.2_S3 |    promH1.2::H1.2::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  19. chip_6_(Atdschip_expr)_2.CEL            |       IP_H1.3_S1 |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  20. chip_7_(Atdschip_tiling)_2.CEL          |       IP_H1.3_S2 |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  21. chip_8_(Atdschip_expr)_2.CEL            |       IP_H1.3_S3 |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  22. chip_H3_6_(Atdschip_tiling)_2.CEL       |       IP_H3_S1   |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  23. chip_H3_7_(Atdschip_expr)_2.CEL         |       IP_H3_S2   |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  24. chip_H3_8_(Atdschip_tiling)_2.CEL       |       IP_H3_S3   |    promH1.3::H1.3::GFP|    stress   |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-H3  |
  25. chip_input13plus31_(Atdschip_expr)_2.CEL|       INP_1      |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        none     |
  26. chip_input36_(Atdschip_tiling)_2.CEL    |       INP_2      |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        none     |
  27. chip_input_35_(Atdschip_tiling)_2.CEL   |       INP_3      |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        none     |
  28. chip_col0F_(Atdschip_tiling)_2.CEL      |       IP_COL_1   |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  29. chip_col0G_(Atdschip_expr)_2.CEL        |       IP_COL_2   |    wild type          |    control  |      organism part-aerial parts|     Col-0  |        anty-GFP |
  30.                                                
  31.                                                
  32. More details can be found:                                             
  33. http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-2804/                                             
  34. http://www.plantphysiol.org/content/early/2015/09/08/pp.15.00493                                               
  35.                                                
  36. stress - low light

Raw Paste


Login or Register to edit or fork this paste. It's free.